Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,249,837 A→T V89V (GTT→GTA)  cirA ← ferric iron‑catecholate outer membrane transporter

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,249,8370AT100.0% 358.6 / NA 127V89V (GTT→GTA) cirAferric iron‑catecholate outer membrane transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base T (0/127);  total (0/127)

Only 100 of 127 total aligned reads displayed.

CAGACCACGAATACTAACGCCCTTACGGTTATCCCCTTCGTTCGTCAGTTGTACGCCAGGCA  >  W3110S.gb/2249822‑2249883
               |                                              
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     cACGAATACTTACGCCCTTACGGTTATCCCCTTCGTTCGTCAGTTGTACGCCAGGCa  <  1:172684/57‑1 (MQ=255)
      aCGAATACTTACGCCCTTACGGTTATCCCCTTCGTTCGTCAGTTGTACGCCAGGCa  <  1:403250/56‑1 (MQ=255)
         aaTACTTACGCCCTTACGGTTATCCCCTTCGTTCGTCAGTTGTACGCCAGTCa  <  1:1264370/53‑1 (MQ=255)
               |                                              
CAGACCACGAATACTAACGCCCTTACGGTTATCCCCTTCGTTCGTCAGTTGTACGCCAGGCA  >  W3110S.gb/2249822‑2249883

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑