Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,325,465 T→C N251N (AAT→AAC)  atoS → sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with AtoC

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,325,4650TC100.0% 288.8 / NA 101N251N (AAT→AAC) atoSsensory histidine kinase in two‑component regulatory system with AtoC
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/101);  total (0/101)

Only 100 of 101 total aligned reads displayed.

GTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGA  >  W3110S.gb/2325458‑2325518
       |                                                     
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       |                                                     
GTGTTAATAACCTCGCCCAGGCACTGCGTGAAACGCGGACACTTAACGATCTGATTATTGA  >  W3110S.gb/2325458‑2325518

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑