| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | W3110S.gb | 2,330,947 | T→C | L57L (TTA→CTA) | atoB → | acetyl‑CoA acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | W3110S.gb | 2,330,947 | 0 | T | C | 99.2% | 343.3 / ‑4.9 | 121 | L57L (TTA→CTA) | atoB | acetyl‑CoA acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (120/0); minor base G (1/0); total (121/0) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
CGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAA > W3110S.gb/2330907‑2330967 | cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGGTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1269334/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTAc > 1:97136/1‑44 (MQ=38)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAATCCGGGCTGGGGc > 1:68842/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGc > 1:1178047/1‑48 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGc > 1:1464881/1‑53 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTgggg > 1:658025/1‑58 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTgggg > 1:924945/1‑58 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTgggg > 1:247819/1‑58 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTgggg > 1:582645/1‑58 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:624801/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:669742/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:65649/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:65097/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:64733/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:6415/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:637417/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:632601/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:626841/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:730079/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:611136/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:590243/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:569591/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:555665/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:538642/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:531068/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:515069/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:501641/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:466398/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:871596/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:972548/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:946137/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:932360/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:929171/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:922007/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:920191/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:91793/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:901336/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:887238/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:876228/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:87226/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:692046/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:847014/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:835429/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:819119/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:797562/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:791201/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:755736/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:742907/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:74211/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:454270/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:721315/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1170931/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1433067/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1426830/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:141904/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1410416/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1386406/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1365305/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1314422/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1272563/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1246779/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1216242/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1181112/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:15094/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1157117/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1145734/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1098196/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1084590/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1078394/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1037935/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:103116/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:101391/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1010981/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1005764/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1004160/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:335047/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:1000167/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:420876/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:419439/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:41071/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:401069/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:391930/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:377413/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:373852/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:372723/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:361662/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:461778/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:315916/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:311813/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:282606/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:269664/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:266670/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:248921/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:235724/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:226693/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:224516/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:169582/1‑59 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGCaa > 1:336938/1‑61 (MQ=255)cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATCGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:566684/1‑59 (MQ=255)cGATTCACGACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc > 1:751061/1‑59 (MQ=255) | CGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAA > W3110S.gb/2330907‑2330967 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |