Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,330,947 T→C L57L (TTA→CTA)  atoB → acetyl‑CoA acetyltransferase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,330,9470TC99.2% 343.3 / ‑4.9 121L57L (TTA→CTA) atoBacetyl‑CoA acetyltransferase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  major base C (120/0);  minor base G (1/0);  total (121/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01

Only 100 of 121 total aligned reads displayed.

CGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAA  >  W3110S.gb/2330907‑2330967
                                        |                    
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGGTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1269334/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTAc                   >  1:97136/1‑44 (MQ=38)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAATCCGGGCTGGGGc    >  1:68842/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGc               >  1:1178047/1‑48 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGc          >  1:1464881/1‑53 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTgggg     >  1:658025/1‑58 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTgggg     >  1:924945/1‑58 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTgggg     >  1:247819/1‑58 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTgggg     >  1:582645/1‑58 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:624801/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:669742/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:65649/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:65097/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:64733/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:6415/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:637417/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:632601/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:626841/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:730079/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:611136/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:590243/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:569591/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:555665/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:538642/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:531068/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:515069/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:501641/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:466398/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:871596/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:972548/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:946137/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:932360/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:929171/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:922007/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:920191/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:91793/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:901336/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:887238/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:876228/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:87226/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:692046/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:847014/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:835429/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:819119/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:797562/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:791201/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:755736/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:742907/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:74211/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:454270/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:721315/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1170931/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1433067/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1426830/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:141904/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1410416/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1386406/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1365305/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1314422/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1272563/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1246779/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1216242/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1181112/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:15094/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1157117/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1145734/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1098196/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1084590/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1078394/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1037935/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:103116/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:101391/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1010981/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1005764/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1004160/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:335047/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:1000167/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:420876/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:419439/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:41071/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:401069/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:391930/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:377413/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:373852/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:372723/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:361662/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:461778/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:315916/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:311813/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:282606/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:269664/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:266670/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:248921/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:235724/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:226693/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:224516/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:169582/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGCaa  >  1:336938/1‑61 (MQ=255)
cGATTCACTACACGTTGATGAAGTGATTATCGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:566684/1‑59 (MQ=255)
cGATTCACGACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGCTACAAGCCGGGCTGGGGc    >  1:751061/1‑59 (MQ=255)
                                        |                    
CGATTCACAACACGTTGATGAAGTGATTATGGGTAACGTGTTACAAGCCGGGCTGGGGCAA  >  W3110S.gb/2330907‑2330967

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: