Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	2,358,400	G→A	A362T (GCT→ACT)	glpA →	sn‑glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase (anaerobic), large subunit, FAD/NAD(P)‑binding

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	2,358,400	0	G	A	100.0%	112.9 / NA	42	A362T (GCT→ACT)	glpA	sn‑glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase (anaerobic), large subunit, FAD/NAD(P)‑binding
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (42/0);  total (42/0)

GCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGGCTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTG  >  W3110S.gb/2358374‑2358435                           |                                    gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGAcg                   >  1:439944/1‑45 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:59553/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:1032889/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:356861/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:407500/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:431923/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:433082/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:436873/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:440818/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:496342/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:572977/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:30480/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:636092/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:639891/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:659524/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:665215/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:739389/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:869189/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:906152/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:956666/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:972711/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:135661/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:1107510/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:1116191/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:1125455/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:1163460/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:120811/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:1228385/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:1324233/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:1327460/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:1335463/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:301279/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:1358922/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:142906/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:166721/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:221182/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:23007/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:249146/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:270338/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:272364/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTg  >  1:289642/1‑62 (MQ=255) gCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGACTGAATGGGCTACCGACGCGGAATGCCGCAAACTg  >  1:958061/1‑62 (MQ=255)                           |                                    GCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGGCTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTG  >  W3110S.gb/2358374‑2358435

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑