Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,423,972 C→T G482G (GGC→GGT yfcC → predicted inner membrane protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,423,9720CT83.3% 94.9 / 10.6 54G482G (GGC→GGTyfcCpredicted inner membrane protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (9/0);  new base T (45/0);  total (54/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.88e-01

AACGCTCGGTGTGTGCAGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTA  >  W3110S.gb/2423924‑2424014
                                                |                                          
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCtt                                >  1:487662/2‑61 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCtt                                >  1:1416579/2‑61 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:626613/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:340674/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:1015042/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:402282/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:402700/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:517185/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:520862/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:523303/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:5966/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:622799/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:62442/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:356300/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:653750/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:661066/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:703819/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:733285/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:764101/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:790226/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:814698/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:869955/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:871519/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:936717/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:948595/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:970672/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:1397250/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:1077600/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:1085776/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:111507/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:116662/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:1170814/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:1174201/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:1195904/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:121037/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:129356/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:132622/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:339378/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:141140/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:1431523/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:152760/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:169531/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:193850/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:245811/2‑62 (MQ=255)
gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg                               >  1:337618/2‑62 (MQ=255)
                             gTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTa  >  1:1399024/1‑62 (MQ=255)
                             gTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTa  >  1:1372891/1‑62 (MQ=255)
                             gTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTa  >  1:1450066/1‑62 (MQ=255)
                             gTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTa  >  1:707362/1‑62 (MQ=255)
                             gTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTa  >  1:218014/1‑62 (MQ=255)
                             gTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTa  >  1:457090/1‑62 (MQ=255)
                             gTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTa  >  1:253359/1‑62 (MQ=255)
                             gTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTa  >  1:375701/1‑62 (MQ=255)
                             gTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTa  >  1:955686/1‑62 (MQ=255)
                                                |                                          
AACGCTCGGTGTGTGCAGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTA  >  W3110S.gb/2423924‑2424014

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: