Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | W3110S.gb | 2,423,981 | A→G | L485L (CTA→CTG) | yfcC → | predicted inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | W3110S.gb | 2,423,981 | 0 | A | G | 83.3% | 99.8 / 10.0 | 54 | L485L (CTA→CTG) | yfcC | predicted inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (9/0); new base G (45/0); total (54/0) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
AACGCTCGGTGTGTGCAGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTA > W3110S.gb/2423924‑2424014 | gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCtt > 1:487662/2‑61 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCtt > 1:1416579/2‑61 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:626613/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:340674/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:1015042/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:402282/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:402700/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:517185/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:520862/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:523303/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:5966/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:622799/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:62442/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:356300/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:653750/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:661066/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:703819/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:733285/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:764101/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:790226/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:814698/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:869955/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:871519/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:936717/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:948595/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:970672/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:1397250/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:1077600/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:1085776/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:111507/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:116662/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:1170814/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:1174201/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:1195904/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:121037/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:129356/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:132622/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:339378/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:141140/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:1431523/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:152760/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:169531/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:193850/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:245811/2‑62 (MQ=255) gaCGCTCGGTGTTTGCCGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGTGCGACCCTGCTTg > 1:337618/2‑62 (MQ=255) gTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTa > 1:1399024/1‑62 (MQ=255) gTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTa > 1:1372891/1‑62 (MQ=255) gTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTa > 1:1450066/1‑62 (MQ=255) gTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTa > 1:707362/1‑62 (MQ=255) gTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTa > 1:218014/1‑62 (MQ=255) gTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTa > 1:457090/1‑62 (MQ=255) gTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTa > 1:253359/1‑62 (MQ=255) gTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTa > 1:375701/1‑62 (MQ=255) gTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTa > 1:955686/1‑62 (MQ=255) | AACGCTCGGTGTGTGCAGGGTGGACTTCCGTAACTGGCTGAAGGTGGGCGCGACCCTACTTGGACTGCTGTTTATTATGTCCAGCGTCGTA > W3110S.gb/2423924‑2424014 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |