Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	232,503	T→C	F193S (TTT→TCT)	yafE →	predicted S‑adenosyl‑L‑methionine‑dependent methyltransferase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	232,503	0	T	C	100.0%	112.8 / NA	41	F193S (TTT→TCT)	yafE	predicted S‑adenosyl‑L‑methionine‑dependent methyltransferase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (41/0);  total (41/0)

AACGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTTTTTCACCAGTGATATCATCATGGTAGATGCA  >  W3110S.gb/232474‑232534                              |                                aaCTTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATatcat               >  1:107731/1‑48 (MQ=38) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:478435/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:965216/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:498696/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:518047/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:518864/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:534392/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:575749/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:607199/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:61394/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:624313/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:629957/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:662654/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:739605/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:764044/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:821769/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:836232/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:948880/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:960521/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:1048256/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:135756/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:1084418/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:1141940/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:1174151/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:1195561/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:1196822/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:1304340/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:1329568/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:450995/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:1372971/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:1412058/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:1420627/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:1471229/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:185793/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:230287/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:376882/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:417546/1‑61 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGc   >  1:877452/1‑60 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGc   >  1:911239/1‑60 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGc   >  1:1112809/1‑60 (MQ=255) aaCGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGATCTTTCACCAGTGATATCATCATGCTAGAAGca  >  1:1387669/1‑61 (MQ=255)                              |                                AACGTATTTTGCCTTGCAGAATGATGGCTTTTTCACCAGTGATATCATCATGGTAGATGCA  >  W3110S.gb/232474‑232534

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑