Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,651,377 C→T A76A (GCC→GCT)  sseA → 3‑mercaptopyruvate sulfurtransferase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,651,3770CT98.7% 208.9 / ‑6.0 77A76A (GCC→GCT) sseA3‑mercaptopyruvate sulfurtransferase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  major base T (76/0);  minor base G (1/0);  total (77/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

GCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCCGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAGG  >  W3110S.gb/2651347‑2651408
                              |                               
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAGCGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:490697/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAAcc     >  1:481958/1‑59 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCa    >  1:1416660/1‑60 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCa    >  1:1325312/1‑60 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCa    >  1:479824/1‑60 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:414254/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:428869/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:449454/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:475568/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:380718/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:364543/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:482060/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:339027/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:558392/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:336308/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:564930/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:575199/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:590438/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:60402/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:617343/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:623602/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:791636/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:995800/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:969006/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:927399/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:846796/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:842218/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:836246/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:812087/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:811810/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:335819/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:769580/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:742070/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:718044/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:707160/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:673726/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:668561/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:645111/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:633256/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:1260871/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:1020757/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:1372242/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:1369026/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:1365687/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:1358247/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:1353258/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:1321009/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:1318050/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:1315431/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:1419540/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:1208922/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:1187046/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:1186255/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:1166805/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:1140417/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:1123436/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:110904/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:105372/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:1431815/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:302117/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:290798/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:288286/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:266199/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:259552/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:25200/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:244741/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:227579/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:222984/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:215847/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:168937/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:16856/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:1458570/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAg   >  1:1425225/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACAAg   >  1:479932/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGTGAATTAGGCG‑TAACCAgg  >  1:224777/1‑61 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCTGTGGCGATGCGGGAATTAGGCGtt         >  1:586955/1‑55 (MQ=255)
gCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCGGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAAcc     >  1:1165918/1‑59 (MQ=255)
                              |                               
GCACATGCTGCCGCGCCCGGAAACGTTCGCCGTGGCGATGCGTGAATTAGGCGTTAACCAGG  >  W3110S.gb/2651347‑2651408

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑