Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,679,974 G→C A476A (GCC→GCG)  yphG ← conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,679,9740GC100.0% 372.4 / NA 130A476A (GCC→GCG) yphGconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base C (130/0);  total (130/0)

Only 100 of 130 total aligned reads displayed.

GGTGAACGGCTGGCGTGATGATATTGCTCCAGATGCTGACCGATAAACCAGGCTTCATCTGT  >  W3110S.gb/2679963‑2680024
           |                                                  
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ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCa       >  1:972948/1‑57 (MQ=255)
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ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTg   >  1:559499/1‑61 (MQ=255)
ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:514471/1‑62 (MQ=255)
ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:685233/1‑62 (MQ=255)
ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:679931/1‑62 (MQ=255)
ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:654911/1‑62 (MQ=255)
ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:647275/1‑62 (MQ=255)
ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:63533/1‑62 (MQ=255)
ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:623014/1‑62 (MQ=255)
ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:571810/1‑62 (MQ=255)
ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:553383/1‑62 (MQ=255)
ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:540138/1‑62 (MQ=255)
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ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:505933/1‑62 (MQ=255)
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ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:134987/1‑62 (MQ=255)
           |                                                  
GGTGAACGGCTGGCGTGATGATATTGCTCCAGATGCTGACCGATAAACCAGGCTTCATCTGT  >  W3110S.gb/2679963‑2680024

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑