Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,679,998 C→T Q468Q (CAG→CAA)  yphG ← conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,679,9980CT100.0% 360.7 / NA 130Q468Q (CAG→CAA) yphGconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (130/0);  total (130/0)

Only 100 of 130 total aligned reads displayed.

GGTGAACGGCTGGCGTGATGATATTGCTCCAGATGCTGACCGATAAACCAGGCTTCATCTGT  >  W3110S.gb/2679963‑2680024
                                   |                          
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ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCa       >  1:972948/1‑57 (MQ=255)
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ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTg   >  1:559499/1‑61 (MQ=255)
ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:514471/1‑62 (MQ=255)
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ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:679931/1‑62 (MQ=255)
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ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:647275/1‑62 (MQ=255)
ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:63533/1‑62 (MQ=255)
ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:623014/1‑62 (MQ=255)
ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:571810/1‑62 (MQ=255)
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ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:134987/1‑62 (MQ=255)
                                   |                          
GGTGAACGGCTGGCGTGATGATATTGCTCCAGATGCTGACCGATAAACCAGGCTTCATCTGT  >  W3110S.gb/2679963‑2680024

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑