Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,680,015 C→T A463T (GCC→ACC)  yphG ← conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,680,0150CT100.0% 352.0 / NA 126A463T (GCC→ACC) yphGconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (126/0);  total (126/0)

Only 100 of 127 total aligned reads displayed.

GGTGAACGGCTGGCGTGATGATATTGCTCCAGATGCTGACCGATAAACCAGGCTTCATCTGT  >  W3110S.gb/2679963‑2680024
                                                    |         
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ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTg   >  1:442299/1‑61 (MQ=255)
ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTg   >  1:559499/1‑61 (MQ=255)
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ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:679931/1‑62 (MQ=255)
ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:654911/1‑62 (MQ=255)
ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:643745/1‑62 (MQ=255)
ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:63533/1‑62 (MQ=255)
ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:623014/1‑62 (MQ=255)
ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTTGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:571810/1‑62 (MQ=255)
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ggTGAACGGCTCGCGTGATGATATTGCTCCAGATGTGGACCGATAAACCAGGTTTCATCTGt  >  1:395481/1‑62 (MQ=255)
                                                    |         
GGTGAACGGCTGGCGTGATGATATTGCTCCAGATGCTGACCGATAAACCAGGCTTCATCTGT  >  W3110S.gb/2679963‑2680024

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑