Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,862,422 G→A P58P (CCG→CCA)  ygbL → predicted class II aldolase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,862,4220GA99.1% 298.9 / ‑5.9 110P58P (CCG→CCA) ygbLpredicted class II aldolase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/1);  new base A (0/109);  total (0/110)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 110 total aligned reads displayed.

GAATTTACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCGCAGCGGCTTT  >  W3110S.gb/2862374‑2862432
                                                |          
ctaTTTACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1463998/57‑1 (MQ=255)
     tACTTGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1135817/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGTCACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:97039/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCGCAGCGGCttt  <  1:509070/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:527138/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:661005/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:630879/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:624675/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:619276/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:555413/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:549967/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:547628/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:541334/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:535729/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:349946/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:362835/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:519276/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:354907/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:504982/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:448276/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:441174/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:421543/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:358483/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:388434/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:3842/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:369292/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:807983/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:952900/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:910823/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:892436/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:878211/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:872828/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:866974/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:861614/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:861450/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:844783/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:842029/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:809203/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:66945/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:804504/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:801408/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:781057/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:771750/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:761218/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:760427/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:73811/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:724639/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:712057/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:706909/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:682138/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1238867/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:133944/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1025269/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:132646/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1314477/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1311406/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1307126/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1278229/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:12613/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1261236/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:124593/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1245095/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1337010/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1226890/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:120720/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1183797/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1152396/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1136790/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1125205/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1090911/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1090415/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1050390/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1048736/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1039845/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:219690/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:326634/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:306857/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:292563/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:259669/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:246776/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:243841/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:2286/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:226744/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1342257/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:20558/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:179988/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:159356/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1462741/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1453507/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1452922/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1431166/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:141650/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1405347/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1381640/54‑1 (MQ=255)
     tACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:136311/54‑1 (MQ=255)
      aCTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:249082/53‑1 (MQ=255)
         ggCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:1199658/50‑1 (MQ=255)
          gCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:934448/49‑1 (MQ=255)
            gACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:554044/47‑1 (MQ=255)
               acCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCACAGCGGCttt  <  1:106453/44‑1 (MQ=255)
                                                |          
GAATTTACTGGCGACACCGACAGGTTCATGCCTGGGCAATCTCGATCCGCAGCGGCTTT  >  W3110S.gb/2862374‑2862432

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑