Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	2,896,425	A→G	V34V (GTT→GTC)	ygcS ←	predicted transporter

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	2,896,425	0	A	G	100.0%	156.8 / NA	56	V34V (GTT→GTC)	ygcS	predicted transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/56);  total (0/56)

GGGCGTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATGACGCCGAGAACATAACCGTCGGTCAGGTGTG  >  W3110S.gb/2896386‑2896447                                        |                       gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAAGCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:797713/62‑1 (MQ=38) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGTTCAGGtgtg  <  1:809910/62‑1 (MQ=38) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:682543/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:1056171/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:371202/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:374039/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:376555/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:405944/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:454139/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:496224/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:521910/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:523005/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:606795/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:618775/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:631760/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:635897/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:352127/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:68380/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:690548/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:764801/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:784803/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:809618/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:84682/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:850285/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:861337/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:873338/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:919874/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:98757/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:1358964/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:1108255/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:1117348/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:1142119/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:1146813/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:1159511/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:1176710/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:1215901/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:125591/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:1273163/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:1301779/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:1334690/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:310874/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:1364165/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:1409273/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:1429789/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:1451777/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:1458876/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:1459652/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:1464362/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:167405/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:225507/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:235468/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:280296/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:295827/62‑1 (MQ=255) gggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGCCGGTCAGGtgtg  <  1:1296964/62‑1 (MQ=38)  ggcgTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:1464518/61‑1 (MQ=255)     gTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATAACGCCGAGGACATAACCGTCGGTCAGGtgtg  <  1:934736/58‑1 (MQ=255)                                        |                       GGGCGTAAGCTGAATAATGGCGTAACCAATGACGCCGAGAACATAACCGTCGGTCAGGTGTG  >  W3110S.gb/2896386‑2896447

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑