Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,911,609 A→G V233V (GTT→GTC)  relA ← (p)ppGpp synthetase I/GTP pyrophosphokinase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,911,6090AG99.3% 399.8 / NA 141V233V (GTT→GTC) relA(p)ppGpp synthetase I/GTP pyrophosphokinase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  major base G (0/140);  minor base T (0/1);  total (0/141)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 141 total aligned reads displayed.

CAGATGACCAACGAACTCTTCGATGTAGTGTTCGCGGTCGAGACGCCGTTCATGCAGCAGTT  >  W3110S.gb/2911600‑2911661
         |                                                    
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCTGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:455808/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGcagcagat  <  1:84571/62‑3 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:454112/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:587566/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:575081/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:563026/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:544650/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:537743/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:52757/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:505047/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:482066/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:469495/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:603993/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:425062/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:383503/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:380372/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:364768/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:339499/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:31598/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:303317/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:297452/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:814493/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:958564/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:940760/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:93814/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:932362/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:916376/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:914889/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:899151/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:89904/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:826712/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1022570/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:81192/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:810078/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:791988/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:705804/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:703583/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:666651/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:623707/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:604987/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1420334/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1243791/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1267261/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1281950/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1226873/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1282099/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1306657/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1226453/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:121870/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1192999/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1353580/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1188513/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1392803/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1402934/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1404477/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1185034/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1434154/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1159025/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1448012/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1148101/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:146663/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:168888/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:200352/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:214195/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:230518/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1112230/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1102094/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:246680/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1093702/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1033825/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:262104/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCCAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:965107/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGGCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:736936/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGGCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:462655/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAAATCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:731454/62‑1 (MQ=255)
 aGATGGCCGACTAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:449179/61‑1 (MQ=255)
 aGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGTGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1213405/61‑1 (MQ=255)
 aGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCTGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:668800/61‑1 (MQ=255)
 aGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1202555/61‑1 (MQ=255)
 aGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:275453/61‑1 (MQ=255)
 aGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1015051/61‑1 (MQ=255)
 aGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:286317/61‑1 (MQ=255)
 aGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:296010/61‑1 (MQ=255)
 aGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:238690/61‑1 (MQ=255)
 aGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:304482/61‑1 (MQ=255)
 aGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:417211/61‑1 (MQ=255)
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 aGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:138010/61‑1 (MQ=255)
 aGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:842898/61‑1 (MQ=255)
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 aGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:627548/61‑1 (MQ=255)
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 aGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:596276/61‑1 (MQ=255)
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 aGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGGTCATGCAGCAGtt  <  1:564010/61‑1 (MQ=255)
         |                                                    
CAGATGACCAACGAACTCTTCGATGTAGTGTTCGCGGTCGAGACGCCGTTCATGCAGCAGTT  >  W3110S.gb/2911600‑2911661

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑