Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,911,624 G→A Y228Y (TAC→TAT)  relA ← (p)ppGpp synthetase I/GTP pyrophosphokinase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,911,6240GA100.0% 403.3 / NA 145Y228Y (TAC→TAT) relA(p)ppGpp synthetase I/GTP pyrophosphokinase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (0/145);  total (0/145)

Only 100 of 145 total aligned reads displayed.

CAGATGACCAACGAACTCTTCGATGTAGTGTTCGCGGTCGAGACGCCGTTCATGCAGCAGTT  >  W3110S.gb/2911600‑2911661
                        |                                     
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cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:600372/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:575081/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:573465/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:563026/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:557133/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:537743/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:52757/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:51563/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:482066/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:473004/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:604987/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:425062/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:383503/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:380372/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:364768/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:339499/62‑1 (MQ=255)
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cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:705804/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:703583/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:696004/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:661266/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:623707/62‑1 (MQ=255)
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cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1434154/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1185034/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1448012/62‑1 (MQ=255)
cAGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1148101/62‑1 (MQ=255)
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 aGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1015051/61‑1 (MQ=255)
 aGATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:296010/61‑1 (MQ=255)
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  gATGGCCGACAAACTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:1291127/60‑1 (MQ=255)
           caaaCTCTTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:270093/49‑1 (MQ=255)
                 ctTCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:728767/45‑1 (MQ=38)
                  ttCGATATAGTGTTCGCGGTCGAGACGGCGTTCATGCAGCAGtt  <  1:137350/44‑1 (MQ=38)
                        |                                     
CAGATGACCAACGAACTCTTCGATGTAGTGTTCGCGGTCGAGACGCCGTTCATGCAGCAGTT  >  W3110S.gb/2911600‑2911661

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑