Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	2,918,809	G→A	Y198Y (TAC→TAT)	gudX ←	predicted glucarate dehydratase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	2,918,809	0	G	A	100.0%	238.8 / NA	91	Y198Y (TAC→TAT)	gudX	predicted glucarate dehydratase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (91/0);  total (91/0)

ACGCCGCCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCGTAGCGA  >  W3110S.gb/2918777‑2918815                                 |       acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAgaga  >  1:151914/1‑39 (MQ=18) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCg   >  1:389006/1‑38 (MQ=21) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCg   >  1:761411/1‑38 (MQ=21) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCg   >  1:659291/1‑38 (MQ=21) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCg   >  1:151170/1‑38 (MQ=21) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCg   >  1:1308699/1‑38 (MQ=21) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCg   >  1:865993/1‑38 (MQ=21) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:686869/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:713237/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:685889/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:684712/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:654888/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:646606/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:613475/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:602462/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:551676/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:514142/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:506950/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:50344/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:474893/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:460484/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:453204/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:446032/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:445565/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:429143/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:389370/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:877961/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:982585/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:962152/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:959079/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:958466/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:937208/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:929022/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:896321/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:894787/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:882503/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:878673/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:702193/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:829791/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:827944/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:822992/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:811571/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:804951/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:803760/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:781896/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:780608/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:723566/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:376861/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1152658/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1380045/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1354110/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1328948/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1324028/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:128510/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1282079/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1228999/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1202052/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1192573/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1188825/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1390946/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1132794/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:110726/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1080630/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1074064/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1067845/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1056549/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1053682/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1037320/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1029745/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:224113/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1028014/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:355648/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:347006/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:329191/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:317885/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:268144/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:267384/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:245236/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:241390/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:387124/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:216089/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:198235/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:164537/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:156362/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1459353/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1444850/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1433734/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1424144/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1411817/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1409174/1‑39 (MQ=25) acGCCACCCTTAAGTCTGAAATCTTTAAAGCCATAGCGa  >  1:1095633/1‑39 (MQ=37)                                 |       ACGCCGCCCTTAAGTTTGAAATCTTTAAAGCCGTAGCGA  >  W3110S.gb/2918777‑2918815

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑