Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,023,318	C→T	G104G (GGC→GGT)	ygfO →	predicted transporter

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,023,318	0	C	T	100.0%	136.4 / NA	50	G104G (GGC→GGT)	ygfO	predicted transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/50);  total (0/50)

TCAATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGCAGCAGCATGAAAAGCGACGGTTT  >  W3110S.gb/3023281‑3023341                                      |                        tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGTTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:38898/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:656362/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:100921/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:291902/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:335301/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:359122/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:457316/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:458678/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:499776/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:518745/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:533546/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:543943/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:565541/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:276393/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:737272/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:741269/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:789394/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:796380/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:79772/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:841486/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:842106/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:956951/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:971747/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:975190/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:994071/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:260652/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:1018590/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:1064303/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:112245/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:1169615/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:1186971/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:1231613/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:1260135/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:1272143/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:1285129/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:1353956/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:1379919/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:1402966/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:1430230/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:1451221/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:1459354/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:152517/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:180028/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:230066/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:255669/61‑1 (MQ=255) tcaATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:275053/61‑1 (MQ=255)  caATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:1129407/60‑1 (MQ=255)  caATTTTTCATTTGTTACGGGCATGATTGCGCTGGGTAGCATCATGAAAAGCGACTGttt  <  1:446088/60‑1 (MQ=255)          cATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:1392419/52‑1 (MQ=255)                          gATTGCGCTGGGTAGCAGCATGAAAAGCGACGGttt  <  1:183447/36‑1 (MQ=255)                                      |                        TCAATTTTTCATTTGTTACGGTCATGATTGCGCTGGGCAGCAGCATGAAAAGCGACGGTTT  >  W3110S.gb/3023281‑3023341

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑