Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,118,808	G→A	P376P (CCC→CCT)	yghK ←	glycolate transporter

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,118,808	0	G	A	98.7%	202.8 / ‑5.4	76	P376P (CCC→CCT)	yghK	glycolate transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (1/0);  new base A (0/75);  total (1/75)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.32e-02
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01

TAGAGATAATCGCCGCAATAAAAATAGCGGTGCCGCCAGCCGAGAGGGGGTCGAATTTAAACACCGCATCCATTGGC  >  W3110S.gb/3118762‑3118838                                               |                               tAGAGATAATCGCCGCAATAAAAATAGCGGTGCCGCCAGCCGAGAGGGGGTCGAATTTAAac                 >  1:249449/1‑62 (MQ=255)                cAATAAAAATAGCGGTGCCTCCAGCCGAGAGAGGGTCGAATTTAAACACCGCATCCATTGGc  <  1:763796/62‑1 (MQ=255)                cAATAAAAATAGCGGTGCCGCCAGCCGAGAGAGTGTCGAATTTAAACACCGCATCCATTGGc  <  1:167560/62‑1 (MQ=255)                cAATAAAAATAGCGGTGCCGCCAGCCGAGAGAGGGTGGAATTTAAACACCGCATCCATTGGc  <  1:137572/62‑1 (MQ=255)                cAATAAAAATAGCGGTGCCGCCAGCCGAGAGAGGGTCGAATTTAAACATCGCATCCATTGGc  <  1:341249/62‑1 (MQ=255)                cAATAAAAATAGCGGTGCCGCCAGCCGAGAGAGGGTCGAATTTAAACACCGCATCCATTgg   <  1:384739/61‑1 (MQ=255)                cAATAAAAATAGCGGTGCCGCCAGCCGAGAGAGGGTCGAATTTAAACACCGCATCCATTGGc  <  1:390291/62‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑