Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,235,693 G→A Q166Q (CAG→CAA)  ygjQ → predicted thioredoxin‑like

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,235,6930GA100.0% 408.1 / NA 144Q166Q (CAG→CAA) ygjQpredicted thioredoxin‑like
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (144/0);  total (144/0)

Only 100 of 144 total aligned reads displayed.

CATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAACAGTACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAACGC  >  W3110S.gb/3235661‑3235722
                                |                             
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCATAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:964327/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATAc                            >  1:386238/1‑36 (MQ=25)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATAc                            >  1:208808/1‑36 (MQ=25)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCt                >  1:1240375/1‑48 (MQ=38)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATc             >  1:384463/1‑51 (MQ=38)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCgg           >  1:474736/1‑53 (MQ=38)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGtt         >  1:1277839/1‑55 (MQ=39)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:522137/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:633061/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:614606/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:585653/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:579374/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:578782/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:573059/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:570651/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:565244/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:564063/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:534561/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:658701/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:495729/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:481010/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:448737/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:427329/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:426423/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:416480/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:390468/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:362580/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:817020/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:995694/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:979177/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:943193/1‑62 (MQ=255)
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cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:907602/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:876609/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:863569/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:855279/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:847494/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:831546/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:82588/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:640630/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:816555/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:80610/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:791460/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:791289/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:7339/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:7333/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:716637/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:713254/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:665546/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:35214/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:654810/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1173623/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:352267/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1362614/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1354789/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1314927/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1299846/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1276669/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1262677/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1235309/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1185677/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1182522/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1181163/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1388414/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1171441/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1170571/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1141814/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1103109/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1089737/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1077458/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1063731/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:104586/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1033373/1‑62 (MQ=255)
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cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:265238/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1000688/1‑62 (MQ=255)
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cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:336524/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:323567/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:321416/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:305382/1‑62 (MQ=255)
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cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:284887/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:277013/1‑62 (MQ=255)
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cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:188670/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:183401/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:172000/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:153906/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:153543/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:15072/1‑62 (MQ=255)
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cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1429869/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:139924/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcg   >  1:867054/1‑61 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCAGTTTTAAcgc  >  1:1349476/1‑62 (MQ=38)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAGCAATACGGAATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:245510/1‑62 (MQ=38)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGC‑AAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1461635/1‑61 (MQ=38)
cATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGAAAAGCAATACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAAcgc  >  1:1143402/1‑62 (MQ=255)
cATAATCAACGCGCCATCAGGCTGGCAAAGCAATACgg                          >  1:299632/1‑38 (MQ=21)
                                |                             
CATAATCAACGCGCCATCTGGCTGGCAAAACAGTACGGCATCGACGCTATCGGTTTTAACGC  >  W3110S.gb/3235661‑3235722

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑