Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,244,521	G→A	T254T (ACG→ACA)	exuT →	hexuronate transporter

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,244,521	0	G	A	100.0%	137.1 / NA	66	T254T (ACG→ACA)	exuT	hexuronate transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (0/66);  total (0/66)

ACCAGGTGAGCACGGCGAAGAAAATGTCCGTTGGTC  >  W3110S.gb/3244508‑3244543              |                       aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:475333/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:674613/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:673774/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:654047/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:581291/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:549199/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:546822/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:508031/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:479236/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:679021/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:473455/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:463420/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:448206/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:443469/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:437287/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:413697/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:395497/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:364814/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:690363/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:697065/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:713165/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:713534/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:734346/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:756929/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:763686/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:791253/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:797677/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:798489/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:806634/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:810219/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:816458/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:82614/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:912923/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:1228322/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:1358333/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:1323171/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:1306989/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:1292422/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:1252108/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:1243645/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:1239328/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:1236022/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:1403097/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:120087/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:1147474/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:1135322/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:1065967/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:1043894/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:1035714/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:1030068/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:1005156/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:142073/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:1439341/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:159553/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:177484/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:198347/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:217831/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:24458/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:262886/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:274438/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:277310/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:296038/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:301122/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:317739/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:329568/36‑1 (MQ=16) aCCAGGTTGACACAGTGAAGAAAATGTCCGTTGGTc  <  1:333368/36‑1 (MQ=16)              |                       ACCAGGTGAGCACGGCGAAGAAAATGTCCGTTGGTC  >  W3110S.gb/3244508‑3244543

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑