Predicted mutation
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RA	W3110S.gb	3,253,812	T→C	A38A (GCT→GCC)	yhaL →	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,253,812	0	T	C	100.0%	224.0 / NA	79	A38A (GCT→GCC)	yhaL	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (79/0);  total (79/0)

GTTGAGCGAGCTGGAAGCTATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAGGATGAAGCTACC  >  W3110S.gb/3253794‑3253857                   |                                              gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGaaa                            >  1:529330/1‑38 (MQ=255) gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGa                              >  1:323074/1‑36 (MQ=255) gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATg          >  1:1336500/1‑56 (MQ=255) gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGc      >  1:316677/1‑60 (MQ=255) gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCt     >  1:1002747/1‑61 (MQ=255) gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCt     >  1:1438955/1‑61 (MQ=255) gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCt     >  1:157848/1‑61 (MQ=255) gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCt     >  1:1390088/1‑61 (MQ=255) gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCt     >  1:590084/1‑61 (MQ=255) 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GTTGAGCGAGCTGGAAGCTATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAGGATGAAGCTACC  >  W3110S.gb/3253794‑3253857

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑