Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,253,845 G→A E49E (GAG→GAA yhaL → hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,253,8450GA100.0% 215.1 / NA 77E49E (GAG→GAAyhaLhypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (77/0);  total (77/0)

GTTGAGCGAGCTGGAAGCTATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAGGATGAAGCTACC  >  W3110S.gb/3253794‑3253857
                                                   |            
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gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCt     >  1:243572/1‑61 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCt     >  1:590084/1‑61 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCt     >  1:157848/1‑61 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCt     >  1:1438955/1‑61 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCt     >  1:1390088/1‑61 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCt     >  1:1372649/1‑61 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCt     >  1:78523/1‑61 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCt     >  1:1324829/1‑61 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCt     >  1:877786/1‑61 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCt     >  1:1234645/1‑61 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCt     >  1:912000/1‑61 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCt     >  1:1152647/1‑61 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCt     >  1:1116359/1‑61 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:980237/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:590469/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:969028/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:971034/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:558857/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:555252/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:524588/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:637739/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:482987/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:411677/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:377139/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:1001760/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:375859/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:983257/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:63451/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:958283/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:638271/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:67848/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:696551/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:724137/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:759242/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:948067/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:78199/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:897758/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:819720/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:837630/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:857837/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:138047/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:1026892/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:1048821/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:1051881/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:1064620/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:1108018/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:1149674/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:1176785/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:1194619/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:1260311/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:1285011/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:1296918/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:1323206/1‑62 (MQ=255)
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gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:362990/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:211199/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:352891/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:259197/1‑62 (MQ=255)
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gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:241549/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:222415/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:212733/1‑62 (MQ=255)
gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:1389478/1‑62 (MQ=255)
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gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTa    >  1:1460008/1‑62 (MQ=255)
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gTTGAGCGAGCTGGAAGCCATCGT‑‑CGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAAGATGAAGCTAcc  >  1:940481/1‑62 (MQ=255)
                                                   |            
GTTGAGCGAGCTGGAAGCTATCGTCGCGGATGCTGAAACGCGTTTAGCCGAGGATGAAGCTACC  >  W3110S.gb/3253794‑3253857

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: