Predicted mutation
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RA	W3110S.gb	3,281,218	A→G	H81R (CAC→CGC)	agaA →	predicted truncated N‑acetylgalactosamine‑6‑phosphate deacetylase

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,281,218	0	A	G	100.0%	235.7 / NA	83	H81R (CAC→CGC)	agaA	predicted truncated N‑acetylgalactosamine‑6‑phosphate deacetylase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/83);  total (0/83)

TATACGTTATGTGGTGAAGAAGTGCAGATGCACGGTGGCGTTGTCCGTACCGCGTCTGGTGG  >  W3110S.gb/3281187‑3281248                                |                               tataCGTTATGTGGTGAAGAAGTGCAGATGCGCGGTGGCGTTTTCCGTACCGCGTCcggtgg  <  1:1460144/62‑1 (MQ=255) tataCGTTATGTGGTGAAGAAGTGCAGATGCGCGGTGGCGTTGTCCGTACCGCGTCcggtgg  <  1:472275/62‑1 (MQ=255) tataCGTTATGTGGTGAAGAAGTGCAGATGCGCGGTGGCGTTGTCCGTACCGCGTCcggtgg  <  1:669442/62‑1 (MQ=255) tataCGTTATGTGGTGAAGAAGTGCAGATGCGCGGTGGCGTTGTCCGTACCGCGTCcggtgg  <  1:627373/62‑1 (MQ=255) tataCGTTATGTGGTGAAGAAGTGCAGATGCGCGGTGGCGTTGTCCGTACCGCGTCcggtgg  <  1:618205/62‑1 (MQ=255) tataCGTTATGTGGTGAAGAAGTGCAGATGCGCGGTGGCGTTGTCCGTACCGCGTCcggtgg  <  1:616119/62‑1 (MQ=255) tataCGTTATGTGGTGAAGAAGTGCAGATGCGCGGTGGCGTTGTCCGTACCGCGTCcggtgg  <  1:599277/62‑1 (MQ=255) tataCGTTATGTGGTGAAGAAGTGCAGATGCGCGGTGGCGTTGTCCGTACCGCGTCcggtgg  <  1:550916/62‑1 (MQ=255) tataCGTTATGTGGTGAAGAAGTGCAGATGCGCGGTGGCGTTGTCCGTACCGCGTCcggtgg  <  1:525153/62‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑