Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,422,984 G→A D232N (GAT→AAT)  yhdZ → predicted amino‑acid transporter subunit

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,422,9840GA100.0% 278.4 / NA 100D232N (GAT→AAT) yhdZpredicted amino‑acid transporter subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (0/100);  total (0/100)

CCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAT  >  W3110S.gb/3422981‑3423042
   |                                                          
ccTAATGAATTTTTTGCGCGTCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:418555/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGGGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:221910/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGTGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:223083/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCATGTAAt  <  1:109223/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:56853/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:779380/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:774786/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:76162/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:747824/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:740766/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:725294/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:685895/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:684373/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:651239/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:622281/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:571208/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:780712/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:567280/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:557941/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:55788/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:554057/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:518900/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:5148/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:513751/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:506064/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:490291/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:483230/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:856476/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:987022/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:964007/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:952184/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:945445/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:934706/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:92431/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:92321/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:918165/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:889238/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:883305/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:878656/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:873700/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:450668/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:849786/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:835754/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:83129/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:826485/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:824552/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:823336/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:802275/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:801743/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:791138/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:783139/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:781357/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1238804/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1404956/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1388887/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1384162/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1370148/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1358746/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1355473/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1328689/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1317667/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1265348/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1259228/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1244655/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1428927/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:123378/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1218344/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1183680/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1085688/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1080449/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1073201/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:106711/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1063934/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1052817/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1025371/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1021040/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:299114/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:460853/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:43979/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:428312/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:412637/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:41228/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:405748/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:389532/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:38149/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:328133/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:310200/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:475338/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:265972/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:263489/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:2508/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:222695/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:216391/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:208950/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:19719/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:192449/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:153184/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:148568/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1443088/62‑1 (MQ=255)
ccTAATGAATTTTATGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAt  <  1:1004558/62‑1 (MQ=255)
   |                                                          
CCTGATGAATTTTTTGCGCATCCTAAATCAGAGCGTACGAGGGCATTTTTATCGCAGGTAAT  >  W3110S.gb/3422981‑3423042

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑