Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,484,167 T→C R195R (CGT→CGC)  ppc → phosphoenolpyruvate carboxylase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,484,1670TC100.0% 363.6 / NA 128R195R (CGT→CGC) ppcphosphoenolpyruvate carboxylase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (128/0);  total (128/0)

Only 100 of 128 total aligned reads displayed.

ATCCGTAAGCTGCGTCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCA  >  W3110S.gb/3484153‑3484189
              |                      
aTCCGTAAACTGGGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1191607/1‑37 (MQ=37)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGcc   >  1:709949/1‑36 (MQ=37)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGcc   >  1:430772/1‑36 (MQ=37)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGcc   >  1:1026143/1‑36 (MQ=37)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:54111/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:689024/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:679848/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:645209/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:639209/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:636892/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:614398/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:583756/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:578842/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:575039/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:559518/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:551962/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:700665/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:538748/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:520980/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:499577/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:476084/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:473792/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:464118/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:462981/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:460286/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:457027/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:992947/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:805822/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:980531/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:954125/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:921273/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:920889/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:897042/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:88006/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:874780/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:859628/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:85277/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:844028/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:819687/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:689991/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:804162/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:795705/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:757522/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:755182/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:744778/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:735415/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:730623/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:712977/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:436553/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:981863/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1192565/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:100308/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1361722/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1340979/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1335468/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1310380/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1303272/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1300960/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1255384/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:124793/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1220160/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1219060/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1216638/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1364380/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1192200/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:116701/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1147416/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1144983/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1128276/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1103622/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:108049/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1061496/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1051038/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1034009/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1023806/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:219297/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:415747/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:393656/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:36289/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:338216/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:313242/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:298730/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:425711/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:281905/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:249127/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:219823/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1372067/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:203868/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:175933/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1472752/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1472705/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1443732/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1433349/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1425746/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:142021/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1413829/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:1398525/1‑37 (MQ=38)
aTCCGTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGAAGAAGCCa  >  1:440472/1‑37 (MQ=21)
aTCCGAAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:838796/1‑37 (MQ=25)
aTCCCTAAACTGCGCCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCa  >  1:516792/1‑37 (MQ=37)
              |                      
ATCCGTAAGCTGCGTCCAAGCCCGGTAGATGAAGCCA  >  W3110S.gb/3484153‑3484189

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑