Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,528,584 G→A A182A (GCC→GCT)  pfkA ← 6‑phosphofructokinase I

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,528,5840GA100.0% 373.9 / NA 133A182A (GCC→GCT) pfkA6‑phosphofructokinase I
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (133/0);  total (133/0)

Only 100 of 156 total aligned reads displayed.

ACAGCCACCGGCAATGGCCGCAGCCAACGTCAGATCTCCACAATAACGGCCCATCACTTCC  >  W3110S.gb/3528569‑3528629
               |                                             
acaGCCGCCGGCAGTAGCCGCAGCCTACGTCAGATCGCCACAATAAc                >  1:1308166/1‑47 (MQ=255)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGAtcg                          >  1:913046/1‑36 (MQ=25)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCcaca                     >  1:82080/1‑42 (MQ=25)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACgg              >  1:541664/1‑49 (MQ=37)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACg               >  1:1448923/1‑48 (MQ=37)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACg               >  1:1156860/1‑48 (MQ=37)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGcc            >  1:213873/1‑51 (MQ=37)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGcc            >  1:823933/1‑51 (MQ=37)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCa       >  1:609721/1‑56 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCa       >  1:1258721/1‑56 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACttac  >  1:363959/1‑59 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACttac  >  1:626949/1‑59 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:394801/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:433801/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:435952/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:42936/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:41670/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:460295/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:406756/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:399418/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:543137/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:38777/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:383937/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:336789/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:331695/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:1006171/1‑61 (MQ=38)
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acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:287124/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:751690/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:982239/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:96027/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:950324/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:941673/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:879374/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:85429/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:83470/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:78964/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:779670/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:498509/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:725631/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:683737/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:638127/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:616598/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:582432/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:317958/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:52751/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:506528/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:1265398/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:1367553/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:132815/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:1327039/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:1305119/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:1281593/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:1279599/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:1277149/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:127211/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:126843/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:265252/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:1251103/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:1230018/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:1219741/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:121498/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:1178082/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:1153400/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:1096318/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:1067487/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:187754/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:228578/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:224557/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:22151/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:217939/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:197910/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:1376919/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:267869/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:181194/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:174691/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:1396722/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:1443464/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:1426307/1‑61 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTc   >  1:444459/1‑60 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTc   >  1:1201413/1‑60 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTc   >  1:733543/1‑60 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTc   >  1:779743/1‑60 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTc   >  1:14083/1‑60 (MQ=38)
acaGCCGCCGGCAATAGCCGAAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATc        >  1:644741/1‑55 (MQ=255)
acaGCCGACGGCAATAGCCGCAGCCAACGTCAGATCGCCACAATAACGGCCCATCACTTcc  >  1:575281/1‑61 (MQ=255)
               ggCCGCAGCCAACGTCAGATCTCCACAATAACGGCCCAt         <  1:305515/39‑1 (MQ=255)
               ggCCGCAGCCAACGTCAGATCTCCACAATAACGGCCCAt         <  1:1103653/39‑1 (MQ=255)
               ggCCGCAGCCAACGTCAGATCTCCACAATAACGGCCCAt         <  1:1231136/39‑1 (MQ=255)
               ggCCGCAGCCAACGTCAGATCTCCACAATAACGGCCCAt         <  1:962172/39‑1 (MQ=255)
               ggCCGCAGCCAACGTCAGATCTCCACAATAACGGCCCAt         <  1:1054677/39‑1 (MQ=255)
               ggCCGCAGCCAACGTCAGATCTCCACAATAACGGCCCAt         <  1:911004/39‑1 (MQ=255)
               ggCCGCAGCCAACGTCAGATCTCCACAATAACGGCCCAt         <  1:1010273/39‑1 (MQ=255)
               ggCCGCAGCCAACGTCAGATCTCCACAATAACGGCCCAt         <  1:1170891/39‑1 (MQ=255)
               ggCCGCAGCCAACGTCAGATCTCCACAATAACGGCCCAt         <  1:789908/39‑1 (MQ=255)
               ggCCGCAGCCAACGTCAGATCTCCACAATAACGGCCCAt         <  1:734089/39‑1 (MQ=255)
               ggCCGCAGCCAACGTCAGATCTCCACAATAACGGCCCAt         <  1:730002/39‑1 (MQ=255)
               ggCCGCAGCCAACGTCAGATCTCCACAATAACGGCCCAt         <  1:668897/39‑1 (MQ=255)
               ggCCGCAGCCAACGTCAGATCTCCACAATAACGGCCCAt         <  1:1448976/39‑1 (MQ=255)
               ggCCGCAGCCAACGTCAGATCTCCACAATAACGGCCCAt         <  1:1382217/39‑1 (MQ=255)
               |                                             
ACAGCCACCGGCAATGGCCGCAGCCAACGTCAGATCTCCACAATAACGGCCCATCACTTCC  >  W3110S.gb/3528569‑3528629

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑