Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,582,818 A→G intergenic (+6/+445) glnG → / ← hemN fused DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with GlnL, nitrogen regulator I (NRI)/coproporphyrinogen III oxidase, SAM and NAD(P)H dependent, oxygen‑independent

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  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,582,8180AG100.0% 150.2 / NA 54intergenic (+6/+445)glnG/hemNfused DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with GlnL, nitrogen regulator I (NRI)/coproporphyrinogen III oxidase, SAM and NAD(P)H dependent, oxygen‑independent
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/54);  total (0/54)

CCCTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACAGCTTGTGTGT  >  W3110S.gb/3582775‑3582828
                                           |          
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cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:438983/54‑1 (MQ=255)
cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:471248/54‑1 (MQ=255)
cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:506952/54‑1 (MQ=255)
cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:513430/54‑1 (MQ=255)
cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:628832/54‑1 (MQ=255)
cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:633380/54‑1 (MQ=255)
cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:638681/54‑1 (MQ=255)
cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:639604/54‑1 (MQ=255)
cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:67784/54‑1 (MQ=255)
cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:309090/54‑1 (MQ=255)
cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:716110/54‑1 (MQ=255)
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cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:72206/54‑1 (MQ=255)
cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:738883/54‑1 (MQ=255)
cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:76274/54‑1 (MQ=255)
cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:766977/54‑1 (MQ=255)
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cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:850327/54‑1 (MQ=255)
cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:87814/54‑1 (MQ=255)
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cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:1377572/54‑1 (MQ=255)
cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:1043783/54‑1 (MQ=255)
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cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:1452673/54‑1 (MQ=255)
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cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:206781/54‑1 (MQ=255)
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cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:297592/54‑1 (MQ=255)
cccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTAACGGCTTgtgtgt  <  1:539329/54‑1 (MQ=255)
 ccTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:694235/53‑1 (MQ=255)
    gACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:810377/50‑1 (MQ=255)
     aCGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATTGAGTGATTCACGGCTTgtgtgt  <  1:300299/49‑1 (MQ=39)
                                           |          
CCCTGACGCGTAAGTTAAAAGAGCTGGGGATGGAGTGATTCACAGCTTGTGTGT  >  W3110S.gb/3582775‑3582828

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: