Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,597,940	A→T	noncoding (1223/2905 nt)	rrlA ←	23S ribosomal RNA

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,597,940	0	A	T	100.0%	80.1 / NA	50	noncoding (1223/2905 nt)	rrlA	23S ribosomal RNA
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base T (0/50);  total (0/50)

TATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTT  >  W3110S.gb/3597900‑3597960                                         |                     caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:754400/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:477436/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:520355/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:589066/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:595023/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:606970/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:685289/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:693748/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:700460/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:707669/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:707745/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:736924/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:737622/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:433582/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:771138/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:813301/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:825015/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:826866/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:851738/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:864915/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:880304/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:883247/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:884720/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:910915/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:952832/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:1321527/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:1047024/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:1050922/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:1117182/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:1130563/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:1148541/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:119078/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:1249866/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:1254273/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:125438/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:1260899/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:127250/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:1308129/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:1020455/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:1349478/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:1388030/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:1423519/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:1432652/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:150876/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:228039/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:280703/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:3032/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:356367/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCTTCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:363632/60‑1 (MQ=11) caTGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCAAGCATCTCAACTCACCTTCACAGGCtt  <  1:1343162/60‑1 (MQ=11)                                         |                     TATGTCAGCATTCGCACTTCTGATACCTCCAGCATGCCTCACAGCACACCTTCACAGGCTT  >  W3110S.gb/3597900‑3597960

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑