Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 366,314 T→C T141A (ACT→GCT)  lacI ← DNA‑binding transcriptional repressor

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb366,3140TC100.0% 372.4 / NA 130T141A (ACT→GCT) lacIDNA‑binding transcriptional repressor
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (130/0);  total (130/0)

Only 100 of 130 total aligned reads displayed.

GCCGGAACATTAGTGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGTT  >  W3110S.gb/366301‑366362
             |                                                
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCCCAGCAATGGCATCATGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1191139/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGGAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:607315/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCt                     >  1:974786/1‑43 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTg                    >  1:7319/1‑44 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:4211/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:567535/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:553627/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:535859/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:529391/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:513003/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:511380/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:504450/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:468695/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:463679/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:463378/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:455269/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:587188/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:413676/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:408014/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:378712/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:371249/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:352398/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:335387/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:329370/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:329027/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1007671/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:321724/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:819583/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:981178/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:976192/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:954407/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:946832/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:945183/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:895670/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:889612/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:879998/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:878383/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:822789/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:569352/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:75935/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:70205/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:696125/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:68687/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:669639/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:664919/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:663276/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:623526/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:327582/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:581560/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1215124/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:321080/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1327373/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1323409/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1310681/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1301801/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1296826/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1290372/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1287008/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1277965/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1261129/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1242302/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:133127/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1182499/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1164766/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1163498/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1151474/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1115213/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1072786/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1065203/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:10453/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1040245/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1019313/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1357635/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:273490/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:24991/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:237980/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:225416/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:196704/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:195666/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:187763/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:172029/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:162110/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:2766/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:158811/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1452661/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1452275/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1437507/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1435733/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:30539/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1402547/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1368672/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1359827/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:321049/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1358920/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCAAGCGGATAGtt  >  1:28205/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATACTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:1344721/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGAATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:728250/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCTTCAACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:617154/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATTAGCGCAGGCAGCATCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGtt  >  1:665808/1‑62 (MQ=255)
gCCGGAACATAAGCGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCa                         >  1:73667/1‑39 (MQ=37)
             |                                                
GCCGGAACATTAGTGCAGGCAGCTTCCACAGCAATGGCATCCTGGTCATCCAGCGGATAGTT  >  W3110S.gb/366301‑366362

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑