Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,683,553	G→T	S215S (TCC→TCA)	ilvE ←	branched‑chain amino‑acid aminotransferase

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,683,553	0	G	T	100.0%	120.6 / NA	45	S215S (TCC→TCA)	ilvE	branched‑chain amino‑acid aminotransferase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base T (45/0);  total (45/0)

TTGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGAGGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAG  >  W3110S.gb/3683515‑3683576                                       |                        ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGt                    >  1:922897/1‑44 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGa                  >  1:589118/1‑46 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGa                  >  1:594391/1‑46 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAAc    >  1:425549/1‑60 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAAc    >  1:725513/1‑60 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:619341/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:330714/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:354427/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:397395/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:405776/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:451294/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:46015/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:535199/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:285591/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:666750/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:692300/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:731610/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:832652/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:883742/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:90249/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:907043/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:977117/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:1371526/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:1013918/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:1079513/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:1097895/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:1126136/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:1160014/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:1160145/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:1195450/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:120971/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:1309044/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:1331746/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:1006361/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:1375235/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:1412677/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:142211/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:147654/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:167629/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:18171/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:219969/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:268512/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:271694/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGATGAGGTGAAAGGTGGGGTGAACAg  >  1:516092/1‑62 (MQ=255) ttGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGAGCGGATGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAg  >  1:1095990/1‑62 (MQ=255)                                       |                        TTGATGATGGCATCACGGGTAATACCCGGCAGCGCGGAGGAGGTGAACGGTGGGGTGAACAG  >  W3110S.gb/3683515‑3683576

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑