Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,704,876	C→T	M164I (ATG→ATA)	trkD ←	potassium transporter

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,704,876	0	C	T	100.0%	132.6 / NA	49	M164I (ATG→ATA)	trkD	potassium transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/49);  total (0/49)

GACCATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAGG  >  W3110S.gb/3704873‑3704933    |                                                          gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:570066/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:228388/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:280600/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:319300/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:391873/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:392165/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:430936/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:437963/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:510561/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:532312/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:542391/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:54742/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:556537/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:167526/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:602546/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:63892/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:733052/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:753570/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:801397/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:81095/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:840145/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:850172/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:868334/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:87846/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:988856/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1270305/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1038893/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1059279/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1078539/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1085932/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1096019/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1107136/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1141797/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1168562/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1199360/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1244425/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1263602/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:101301/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1277903/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1305401/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1321616/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1337052/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1356351/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1371338/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1376747/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1389479/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1392908/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:159961/61‑1 (MQ=255) gACTATAGCCCTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAgg  <  1:1411077/61‑1 (MQ=255)    |                                                          GACCATAGCCGTGCCATGTTTTTGAATCATAAATAATAAAGTGAGAACGATAATTGAGAGG  >  W3110S.gb/3704873‑3704933

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑