Predicted mutation
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RA	W3110S.gb	3,746,249	T→C	A52A (GCA→GCG)	mdtL ←	multidrug efflux system protein

Read alignment evidence...
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*	W3110S.gb	3,746,249	0	T	C	100.0%	263.3 / NA	92	A52A (GCA→GCG)	mdtL	multidrug efflux system protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/92);  total (0/92)

CAAATAACATCGCAGCTGCCATCCCCGCCAGATATACGGAGAACGCAATATGCAACTGCGCT  >  W3110S.gb/3746233‑3746294                 |                                              cAAATAGCATCGCAGCCGCCATCCCCGCCAGATAAACGGAGAACGCAATATGCAACTGCGCt  <  1:502593/62‑1 (MQ=255) cAAATAACATCGCAGGCGCCATCCCCGCCAGATAAACGGAGAACGCAATATGCAACTGCGCt  <  1:1282819/62‑1 (MQ=255) cAAATAACATCGCAGCCGCCATCCCCGCCAGATAAACGGAGAACGCAATATGCAACTGCGCt  <  1:396388/62‑1 (MQ=255) cAAATAACATCGCAGCCGCCATCCCCGCCAGATAAACGGAGAACGCAATATGCAACTGCGCt  <  1:58382/62‑1 (MQ=255) cAAATAACATCGCAGCCGCCATCCCCGCCAGATAAACGGAGAACGCAATATGCAACTGCGCt  <  1:579448/62‑1 (MQ=255) cAAATAACATCGCAGCCGCCATCCCCGCCAGATAAACGGAGAACGCAATATGCAACTGCGCt  <  1:561997/62‑1 (MQ=255) cAAATAACATCGCAGCCGCCATCCCCGCCAGATAAACGGAGAACGCAATATGCAACTGCGCt  <  1:508391/62‑1 (MQ=255) cAAATAACATCGCAGCCGCCATCCCCGCCAGATAAACGGAGAACGCAATATGCAACTGCGCt  <  1:49173/62‑1 (MQ=255) cAAATAACATCGCAGCCGCCATCCCCGCCAGATAAACGGAGAACGCAATATGCAACTGCGCt  <  1:43067/62‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑