Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,770,780	G→T	L87L (CTC→CTA)	cbrA ←	predicted oxidoreductase, FAD/NAD(P)‑binding domain

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,770,780	0	G	T	100.0%	171.2 / NA	62	L87L (CTC→CTA)	cbrA	predicted oxidoreductase, FAD/NAD(P)‑binding domain
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base T (0/62);  total (0/62)

ATAGCTTCGCTGGTAGTTACGCGTGAGCGATGCGGCGACGTCGACGGTTTTGACGCTGAAAA  >  W3110S.gb/3770756‑3770817                         |                                      ataGCTTCGCTGGTAGTTACGCGTTAGCGATGCGGCGACGTCGACGGTTTTGACGCTGaata  <  1:829870/62‑3 (MQ=255) ataGCTTCGCTGGTAGTTACGCGTTAGCGATGCGGCGACGTCGACGGTTTTGACGCTGaaaa  <  1:700723/62‑1 (MQ=255) ataGCTTCGCTGGTAGTTACGCGTTAGCGATGCGGCGACGTCGACGGTTTTGACGCTGaaaa  <  1:1021748/62‑1 (MQ=255) ataGCTTCGCTGGTAGTTACGCGTTAGCGATGCGGCGACGTCGACGGTTTTGACGCTGaaaa  <  1:355906/62‑1 (MQ=255) ataGCTTCGCTGGTAGTTACGCGTTAGCGATGCGGCGACGTCGACGGTTTTGACGCTGaaaa  <  1:407841/62‑1 (MQ=255) ataGCTTCGCTGGTAGTTACGCGTTAGCGATGCGGCGACGTCGACGGTTTTGACGCTGaaaa  <  1:414482/62‑1 (MQ=255) ataGCTTCGCTGGTAGTTACGCGTTAGCGATGCGGCGACGTCGACGGTTTTGACGCTGaaaa  <  1:471303/62‑1 (MQ=255) ataGCTTCGCTGGTAGTTACGCGTTAGCGATGCGGCGACGTCGACGGTTTTGACGCTGaaaa  <  1:471558/62‑1 (MQ=255) ataGCTTCGCTGGTAGTTACGCGTTAGCGATGCGGCGACGTCGACGGTTTTGACGCTGaaaa  <  1:495037/62‑1 (MQ=255) 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ataGCTTCGCTGGTAGTTACGCGTTAGCGATGCGGCGACGTCGACGGTTTTGACGCTGaaaa  <  1:172949/62‑1 (MQ=255) ataGCTTCGCTGGTAGTTACGCGTTAGCGATGCGGCGACGTCGACGGTTTTGACGCTGaaaa  <  1:257818/62‑1 (MQ=255) ataGCTTCGCTGGTAGTTACGCGTTAGCGATGCGGCGACGTCGACGGTTTTGACGCTGaaaa  <  1:298511/62‑1 (MQ=255) ataGCTTCGCTGGTAGTTACGCGTTAGCGATGCGGCGACGTCGACGGTTTTGACGCTGaaaa  <  1:283691/62‑1 (MQ=255) ataGCTTCGCTGGTAGTTACGCGTTAGCGATGCGCCGACGTCGACGGTTTTGACGCTGaaaa  <  1:1115890/62‑1 (MQ=255)  taGCTTCGCTGGTAGTTACGCGTTAGCGATGCGGCGACGTCGACGGTTTTGACGCTGaaaa  <  1:1024539/61‑1 (MQ=255)        cGCTGGTAGTTACGCGTTAGCGATGCGGCGACGTCGACGGTTTTGACGCTGaaaa  <  1:1152323/55‑1 (MQ=255)            ggTAGTTACGCGTTAGCGATGCGGCGACGTCGACGGTTTTGACGCTGaaaa  <  1:1088588/51‑1 (MQ=255)                  tACGCGTTAGCGATGCGGCGACGTCGACGGTTTTGACGCTGaaaa  <  1:951085/45‑1 (MQ=255)                         |                                      ATAGCTTCGCTGGTAGTTACGCGTGAGCGATGCGGCGACGTCGACGGTTTTGACGCTGAAAA  >  W3110S.gb/3770756‑3770817

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑