Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,805,267 C→T G260G (GGC→GGT)  yicJ → predicted transporter

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,805,2670CT100.0% 315.7 / NA 114G260G (GGC→GGT) yicJpredicted transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (114/0);  total (114/0)

Only 100 of 114 total aligned reads displayed.

TGGATTTTGGGCACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACTT  >  W3110S.gb/3805256‑3805301
           |                                  
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCtttt            >  1:660696/1‑36 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTtctc         >  1:54287/1‑39 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTtctc         >  1:1216875/1‑39 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTtct          >  1:392069/1‑38 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTtct          >  1:171493/1‑38 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:479325/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:614547/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:609984/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:592042/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:586139/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:572207/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:564030/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:530058/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:529315/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:528804/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:515253/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:343699/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:468905/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:468802/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:465910/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:458347/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:408357/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:377654/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:365695/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:363026/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:350087/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:303610/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:848543/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:988213/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:94886/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:940147/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:915687/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:903552/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:898244/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:897284/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:893589/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:88133/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:868769/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:860386/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:655187/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:844606/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:802541/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:781095/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:763441/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:757692/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:747843/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:745466/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:696609/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:690655/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:685653/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:668830/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1242265/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1390066/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1361741/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1347093/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1346134/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1313963/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1306790/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1296402/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1292480/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:129124/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:128747/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1271175/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1391782/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1227237/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1224820/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1191526/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1187671/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1149932/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:113366/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1131539/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1075827/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1042765/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1039815/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1037378/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:196430/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1027727/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:295364/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:288814/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:281967/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:274719/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:269823/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:268448/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:248764/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:212981/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:19849/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:305777/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:190146/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:166413/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1465056/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1463909/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1449690/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1447920/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1436198/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:142601/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1416654/1‑46 (MQ=255)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACAACtt  >  1:1161810/1‑46 (MQ=39)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTATCTCACCACt   >  1:283830/1‑45 (MQ=38)
tGGATTTTGGGTACGCCGGAAGTGGTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1438120/1‑46 (MQ=255)
tGGATGTTGGGTACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACtt  >  1:1415772/1‑46 (MQ=39)
           |                                  
TGGATTTTGGGCACGCCGGAAGTGTTTGTCGCTTTTCTCACCACTT  >  W3110S.gb/3805256‑3805301

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑