Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,968,209 C→T intergenic (‑134/‑314) yhjC ← / → yhjB predicted DNA‑binding transcriptional regulator/predicted DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,968,2090CT100.0% 262.1 / NA 95intergenic (‑134/‑314)yhjC/yhjBpredicted DNA‑binding transcriptional regulator/predicted DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (95/0);  total (95/0)

CTTAAACAGAGCGTATTTTTCAGCGATTCCCTTTAAAGTGAACAGAGGACGTGTTGGCTATT  >  W3110S.gb/3968167‑3968228
                                          |                   
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                                          |                   
CTTAAACAGAGCGTATTTTTCAGCGATTCCCTTTAAAGTGAACAGAGGACGTGTTGGCTATT  >  W3110S.gb/3968167‑3968228

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: