Predicted mutation
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RA	W3110S.gb	3,968,219	G→A	intergenic (‑144/‑304)	yhjC ← / → yhjB	predicted DNA‑binding transcriptional regulator/predicted DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,968,219	0	G	A	100.0%	262.1 / NA	94	intergenic (‑144/‑304)	yhjC/yhjB	predicted DNA‑binding transcriptional regulator/predicted DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (94/0);  total (94/0)

CTTAAACAGAGCGTATTTTTCAGCGATTCCCTTTAAAGTGAACAGAGGACGTGTTGGCTATT  >  W3110S.gb/3968167‑3968228                                                     |          cTTAATCAGAGCGTATTTTTCAGAGATTCACTTTAAAGTGAATAGAAGATGTATTGGCTAtt  >  1:545007/1‑62 (MQ=255) cTTAAACAGAGCGTATTTTTCAGCGATTCACTTTAAAGTGAATAGAAGATGTATTGGCTAtt  >  1:490837/1‑62 (MQ=255) cTTAAACAGAGCGTATTTTTCAGCGATTCACTTTAAAGTGAATAGAAGATGTATTGGCTAtt  >  1:63178/1‑62 (MQ=255) cTTAAACAGAGCGTATTTTTCAGCGATTCACTTTAAAGTGAATAGAAGATGTATTGGCTAtt  >  1:629604/1‑62 (MQ=255) cTTAAACAGAGCGTATTTTTCAGCGATTCACTTTAAAGTGAATAGAAGATGTATTGGCTAtt  >  1:607263/1‑62 (MQ=255) cTTAAACAGAGCGTATTTTTCAGCGATTCACTTTAAAGTGAATAGAAGATGTATTGGCTAtt  >  1:584782/1‑62 (MQ=255) cTTAAACAGAGCGTATTTTTCAGCGATTCACTTTAAAGTGAATAGAAGATGTATTGGCTAtt  >  1:569440/1‑62 (MQ=255) cTTAAACAGAGCGTATTTTTCAGCGATTCACTTTAAAGTGAATAGAAGATGTATTGGCTAtt  >  1:53939/1‑62 (MQ=255) cTTAAACAGAGCGTATTTTTCAGCGATTCACTTTAAAGTGAATAGAAGATGTATTGGCTAtt  >  1:535944/1‑62 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑