| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | W3110S.gb | 448,360 | T→C | A502A (GCA→GCG) | cyoB ← | cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | W3110S.gb | 448,360 | 0 | T | C | 90.8% | 280.7 / 11.0 | 120 | A502A (GCA→GCG) | cyoB | cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/11); new base C (0/109); total (0/120) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
AGTACTGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTCAAA > W3110S.gb/448355‑448420 | aGTACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCT‑CTGGCTc < 1:230409/62‑1 (MQ=255) tACCGCACGGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:903629/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCTGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:423513/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:571434/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:620877/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:549962/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:544383/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:509291/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:471478/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:46700/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:45260/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:431669/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:409287/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:407469/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:382280/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:357527/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:347536/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:345824/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:343595/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:316557/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:307465/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:306613/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1018892/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:269891/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:829446/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:981735/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:972576/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:944188/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:936120/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:914037/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:895998/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:891870/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:855433/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:85502/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:8368/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:301615/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:784289/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:74343/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:741626/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:739972/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:722578/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:710742/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:690744/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:685440/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:659931/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:657696/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1080274/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1319380/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1301290/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1287164/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1281768/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:199812/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1269559/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:125418/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1252260/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1226871/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1224790/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1337818/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1211838/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1203545/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1194797/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1192566/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1185774/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1149196/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:114521/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1135180/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1128991/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1106211/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1417637/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1025285/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:186616/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:173019/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:164252/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:150085/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1468661/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:10322/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1451847/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1450017/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1436375/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:139928/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1389955/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1033814/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1380309/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1372433/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1355921/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1345438/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1041183/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1068803/61‑1 (MQ=255) tACCGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTc < 1:1076727/61‑1 (MQ=255) cTGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTCaaa < 1:615867/62‑1 (MQ=255) cTGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTCaaa < 1:1098036/62‑1 (MQ=255) cTGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTCaaa < 1:767678/62‑1 (MQ=255) cTGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTCaaa < 1:706493/62‑1 (MQ=255) cTGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTCaaa < 1:460195/62‑1 (MQ=255) cTGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTCaaa < 1:453826/62‑1 (MQ=255) cTGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTCaaa < 1:1389389/62‑1 (MQ=255) cTGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTCaaa < 1:310309/62‑1 (MQ=255) cTGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTCaaa < 1:214932/62‑1 (MQ=255) tGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTCaaa < 1:897860/61‑1 (MQ=255) tGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGGCAATCTGCTGGCGCaaa < 1:1342522/61‑1 (MQ=255) | AGTACTGCACCGCTGGCTGCAATCATCAGCATGGTGTGGAACTGCGGGTCAATCTGCTGGCTCAAA > W3110S.gb/448355‑448420 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |