Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,083,397 C→T S353S (AGC→AGT)  rtcB → conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,083,3970CT100.0% 318.2 / NA 113S353S (AGC→AGT) rtcBconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/113);  total (0/113)

Only 100 of 113 total aligned reads displayed.

CAGCGTGGAAGATCAAATTCGTGCCACCGCGCATGTGGAATGCCGTAAAGATGCCGAAGTGA  >  W3110S.gb/4083394‑4083455
   |                                                          
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   |                                                          
CAGCGTGGAAGATCAAATTCGTGCCACCGCGCATGTGGAATGCCGTAAAGATGCCGAAGTGA  >  W3110S.gb/4083394‑4083455

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑