Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,083,412 T→C I358I (ATT→ATC)  rtcB → conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,083,4120TC100.0% 334.6 / NA 116I358I (ATT→ATC) rtcBconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/116);  total (0/116)

Only 100 of 116 total aligned reads displayed.

CAGCGTGGAAGATCAAATTCGTGCCACCGCGCATGTGGAATGCCGTAAAGATGCCGAAGTGA  >  W3110S.gb/4083394‑4083455
                  |                                           
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 agtgTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:298364/58‑1 (MQ=255)
 agtgTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:305230/58‑1 (MQ=255)
                  |                                           
CAGCGTGGAAGATCAAATTCGTGCCACCGCGCATGTGGAATGCCGTAAAGATGCCGAAGTGA  >  W3110S.gb/4083394‑4083455

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑