Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,083,451 A→G E371E (GAA→GAG)  rtcB → conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,083,4510AG100.0% 348.1 / NA 122E371E (GAA→GAG) rtcBconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/122);  total (0/122)

Only 100 of 122 total aligned reads displayed.

CAGCGTGGAAGATCAAATTCGTGCCACCGCGCATGTGGAATGCCGTAAAGATGCCGAAGTGA  >  W3110S.gb/4083394‑4083455
                                                         |    
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cAGTGTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:400802/62‑1 (MQ=255)
cAGTGTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:632310/62‑1 (MQ=255)
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cAGTGTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:548195/62‑1 (MQ=255)
cAGTGTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:547412/62‑1 (MQ=255)
cAGTGTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:50648/62‑1 (MQ=255)
cAGTGTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:467680/62‑1 (MQ=255)
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cAGTGTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:415582/62‑1 (MQ=255)
cAGTGTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:404344/62‑1 (MQ=255)
cAGTGTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:679184/62‑1 (MQ=255)
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cAGTGTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:1223654/62‑1 (MQ=255)
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cAGTGTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:1102759/62‑1 (MQ=255)
cAGTGTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:1101733/62‑1 (MQ=255)
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cAGTGTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:1047908/62‑1 (MQ=255)
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cAGTGTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:976524/62‑1 (MQ=255)
cAGTGTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:1325641/62‑1 (MQ=255)
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cAGTGTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:186527/62‑1 (MQ=255)
cAGTGTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:183639/62‑1 (MQ=255)
cAGTGTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:170204/62‑1 (MQ=255)
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 agtgTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:298364/58‑1 (MQ=255)
 agtgTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:305230/58‑1 (MQ=255)
 agtgTGGAAGATCAAATCCGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:1375105/58‑1 (MQ=255)
                  ccGTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:221472/43‑1 (MQ=38)
                    gTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:1225003/42‑1 (MQ=38)
                    gTGCCACCGCGCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:1031511/42‑1 (MQ=38)
                           cgcgCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:224372/35‑1 (MQ=37)
                           cgcgCATGTGGAGTGCCGTAAAGATGCCGAGGTGa  <  1:1261688/35‑1 (MQ=37)
                                                         |    
CAGCGTGGAAGATCAAATTCGTGCCACCGCGCATGTGGAATGCCGTAAAGATGCCGAAGTGA  >  W3110S.gb/4083394‑4083455

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑