Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	4,127,655	T→C	Y292Y (TAT→TAC)	trpS →	tryptophanyl‑tRNA synthetase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	4,127,655	0	T	C	100.0%	103.7 / NA	38	Y292Y (TAT→TAC)	trpS	tryptophanyl‑tRNA synthetase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (38/0);  total (38/0)

GATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGCTATCACCGTTTCCGCAACGATGA  >  W3110S.gb/4127614‑4127675                                          |                     gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATg   >  1:1226057/1‑61 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATg   >  1:593921/1‑61 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:686251/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:388890/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:395246/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:438236/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:456865/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:463593/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:519241/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:53504/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:603657/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:386286/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:724901/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:826360/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:833866/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:854714/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:897456/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:965150/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:971913/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:978241/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:1307641/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:1011724/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:1012371/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:1015430/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:1028928/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:1092931/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:1220557/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:1278700/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:1280381/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:1000635/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:131366/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:1328501/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:1330188/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:1360666/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:156753/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:241583/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:306711/1‑62 (MQ=255) gATGCCGTTTCCGGAATGCTGACTGAATTGCAGGAACGTTACCACCGTTTCCGCAACGATGa  >  1:202677/1‑62 (MQ=38)                                          |                     GATGCCGTTTCCGGTATGCTGACTGAATTGCAGGAACGCTATCACCGTTTCCGCAACGATGA  >  W3110S.gb/4127614‑4127675

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑