Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	4,152,644	G→A	I328I (ATC→ATT)	yhfK ←	conserved inner membrane protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	4,152,644	0	G	A	100.0%	267.8 / NA	97	I328I (ATC→ATT)	yhfK	conserved inner membrane protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (0/97);  total (0/97)

TTTTGGGTGCGCAGCACGCGGGCGATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCA  >  W3110S.gb/4152621‑4152667                        |                        ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:575456/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:702487/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:689697/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:688095/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:683551/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:651745/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:642531/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:641884/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:638087/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:624965/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:614448/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:610144/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:70360/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:54465/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:503640/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:498125/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:497733/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:479894/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:426812/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:412254/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:410617/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:409388/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:40446/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1036267/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:842583/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:992352/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:985625/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:98374/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:981346/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:977369/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:968370/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:941240/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:932762/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:89981/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:867169/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:855209/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:400420/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:836465/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:789125/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:780355/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:771587/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:766829/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:758363/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:755557/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:736570/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:727125/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:713448/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:705847/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1192348/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1332363/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1328062/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:397135/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:130578/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:128659/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1281326/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1277968/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1265968/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1256422/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1218245/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1323616/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1182677/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1165566/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1160894/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1139906/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1104237/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1103768/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1097846/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1079282/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1069970/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1037973/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:233541/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:312536/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:29530/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:322958/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:264231/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:254692/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1341766/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:233842/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:341433/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:227787/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:225503/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:224114/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:370089/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:205608/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1464553/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1426193/47‑1 (MQ=255) ttttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1396915/47‑1 (MQ=255)  tttGGGTGCGCAGCTCACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:96794/46‑1 (MQ=255)  tttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1161011/46‑1 (MQ=255)  tttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1137333/46‑1 (MQ=255)  tttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:970882/46‑1 (MQ=255)  tttGGGTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1389037/46‑1 (MQ=255)      ggTGCGCAGCACACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1180991/42‑1 (MQ=255)            cagcaCACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:276498/36‑1 (MQ=37)            cagcaCACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:1215814/36‑1 (MQ=37)            cagcaCACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:21379/36‑1 (MQ=37)            cagcaCACGAGCAATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCa  <  1:371783/36‑1 (MQ=37)                        |                        TTTTGGGTGCGCAGCACGCGGGCGATGCGGCTGAAATGCCAGTAGCA  >  W3110S.gb/4152621‑4152667

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑