Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	4,190,315	C→T	A44V (GCT→GTT)	rplV →	50S ribosomal subunit protein L22

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	4,190,315	0	C	T	100.0%	110.7 / NA	41	A44V (GCT→GTT)	rplV	50S ribosomal subunit protein L22
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/41);  total (0/41)

GCGGCTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATGG  >  W3110S.gb/4190311‑4190372     |                                                          tcGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:911608/61‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAGCGATgg  <  1:514520/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:582809/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:315802/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:317930/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:33653/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:408478/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:420247/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:426333/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:427528/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:456920/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:515755/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:303373/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:586616/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:672716/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:78688/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:840589/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:938556/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:956145/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:966130/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:995831/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:1426871/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:1061490/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:1131122/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:1151548/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:1172947/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:1180362/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:1214664/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:1215697/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:1325334/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:138354/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:1038446/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:1431283/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:1472570/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:147794/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:167965/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:196703/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:19831/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:246046/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:290909/62‑1 (MQ=255) gCGGTTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATgg  <  1:300570/62‑1 (MQ=255)     |                                                          GCGGCTGTACTGGTCAAGAAAGTTCTGGAATCTGCCATTGCTAACGCTGAACACAACGATGG  >  W3110S.gb/4190311‑4190372

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑