Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	4,260,515	A→T	D96V (GAT→GTT)	dgkA →	diacylglycerol kinase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	4,260,515	0	A	T	100.0%	129.0 / NA	48	D96V (GAT→GTT)	dgkA	diacylglycerol kinase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base T (0/48);  total (0/48)

CCATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGATATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTATCG  >  W3110S.gb/4260489‑4260550                           |                                    gcATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGTGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:1342324/61‑1 (MQ=39) gcATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:274897/61‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:812244/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:518288/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:578345/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:636710/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:667703/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:70243/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:718052/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:718145/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:744041/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:748676/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:787781/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:808454/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:513126/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:826765/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:831614/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:880058/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:906881/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:939887/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:949235/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:965181/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:981431/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:996427/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:998051/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:175320/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:1071322/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:1128570/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:122553/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:1250554/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:1251707/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:125362/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:1382546/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:1448684/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:1451979/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:14523/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:1025396/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:223299/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:228033/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:266975/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:33139/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:338972/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:342541/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:400263/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:400542/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:474213/62‑1 (MQ=255) ccATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:489173/62‑1 (MQ=255)                  gcgcAAAAGTTATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTAtcg  <  1:851558/45‑1 (MQ=255)                           |                                    CCATGAGCTTTCCGGACGCGCAAAAGATATGGGATCCGCTGCGGTGCTGATTGCCATTATCG  >  W3110S.gb/4260489‑4260550

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑