Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,279,503 T→C Y147Y (TAT→TAC yjcC → predicted signal transduction protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,279,5030TC100.0% 240.2 / NA 84Y147Y (TAT→TACyjcCpredicted signal transduction protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/84);  total (0/84)

CGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCG  >  W3110S.gb/4279467‑4279511
                                    |        
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tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATATAATTACCTACATGCAGCg  <  1:282670/44‑1 (MQ=25)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGct  <  1:258349/44‑2 (MQ=38)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:601074/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:60207/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:541524/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:516779/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:501048/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:471151/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:464490/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:388137/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:384590/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:380110/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:3643/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:354288/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:327532/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:305140/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:302895/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:299768/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1019172/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:714236/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:962162/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:934200/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:890419/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:82829/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:821015/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:802254/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:746536/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:742732/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:742704/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:290943/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:713196/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:685877/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:684563/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:681945/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:671408/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:671073/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:661173/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:65658/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:640492/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1195528/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1360521/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1339380/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1323746/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1297802/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:126820/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1250110/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1229869/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1206811/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1203752/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:260888/44‑1 (MQ=255)
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tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:118145/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1163268/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1153410/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1144517/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1140162/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1135236/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:10830/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:105897/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1454847/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:250198/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:218619/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:21730/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:215457/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:177009/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1367291/44‑1 (MQ=255)
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tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1423631/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1412954/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1404110/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1397128/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1376461/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1370687/44‑1 (MQ=255)
tgATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1369261/44‑1 (MQ=255)
 gATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:716264/44‑1 (MQ=255)
 gATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:752046/44‑1 (MQ=255)
 gATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:483378/44‑1 (MQ=255)
 gATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:293883/44‑1 (MQ=255)
 gATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1122867/44‑1 (MQ=255)
  aTACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:341859/43‑1 (MQ=255)
   tACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1194393/42‑1 (MQ=255)
      gCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTACATGCAGCg  <  1:1048358/39‑1 (MQ=255)
                                    |        
CGATACGCCTTTTTTCTCTGGCTATAAAATGACCTATATGCAGCG  >  W3110S.gb/4279467‑4279511

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: