Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,317,480 T→G I64I (ATA→ATC)  rpiR ← DNA‑binding transcriptional repressor

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,317,4800TG100.0% 283.7 / NA 99I64I (ATA→ATC) rpiRDNA‑binding transcriptional repressor
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base G (99/0);  total (99/0)

AGCAGCTTTGATACCTTAACTATCATCGCTTCAGATACCGCCAGAGCTTCTGCGACATCTTT  >  W3110S.gb/4317460‑4317521
                    |                                         
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                    |                                         
AGCAGCTTTGATACCTTAACTATCATCGCTTCAGATACCGCCAGAGCTTCTGCGACATCTTT  >  W3110S.gb/4317460‑4317521

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑