Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	4,350,081	C→T	R53K (AGA→AAA)	yjdF ←	conserved inner membrane protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	4,350,081	0	C	T	100.0%	157.6 / NA	58	R53K (AGA→AAA)	yjdF	conserved inner membrane protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (58/0);  total (58/0)

GCAGCGGCGTTAACGGATAACGTCTGGCGGTGGCAAGCAGTAGCTGCACGACAATAATCACC  >  W3110S.gb/4350058‑4350119                        |                                       gcagcGGCGTTAACGGATAACGTTTAGCGGTGGCAAGCa                         >  1:1046182/1‑39 (MQ=37) gcagcGGCGTTAACGGATAACGTTTAGCGGTGGCAAGCAGTAGc                    >  1:365205/1‑44 (MQ=38) gcagcGGCGTTAACGGATAACGTTTAGCGGTGGCAAGCAGTAGCGGCACGACAATAATCAcc  >  1:660619/1‑62 (MQ=255) gcagcGGCGTTAACGGATAACGTTTAGCGGTGGCAAGCAGTAGCGGCACGACAATAATCAcc  >  1:150367/1‑62 (MQ=255) gcagcGGCGTTAACGGATAACGTTTAGCGGTGGCAAGCAGTAGCGGCACGACAATAATCAcc  >  1:29107/1‑62 (MQ=255) gcagcGGCGTTAACGGATAACGTTTAGCGGTGGCAAGCAGTAGCGGCACGACAATAATCAcc  >  1:328288/1‑62 (MQ=255) gcagcGGCGTTAACGGATAACGTTTAGCGGTGGCAAGCAGTAGCGGCACGACAATAATCAcc  >  1:360904/1‑62 (MQ=255) gcagcGGCGTTAACGGATAACGTTTAGCGGTGGCAAGCAGTAGCGGCACGACAATAATCAcc  >  1:4293/1‑62 (MQ=255) gcagcGGCGTTAACGGATAACGTTTAGCGGTGGCAAGCAGTAGCGGCACGACAATAATCAcc  >  1:448104/1‑62 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑