Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,576,531 C→A R33R (CGC→CGA)  yjiS → conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,576,5310CA100.0% 356.3 / NA 128R33R (CGC→CGA) yjiSconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base A (0/128);  total (0/128)

Only 100 of 128 total aligned reads displayed.

AGGCGGTGAGGCGTTGGCGGCGGCAAATGCAGACCCGACGCGTGTTACAGCAG  >  W3110S.gb/4576491‑4576543
                                        |            
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               ggcggcggcAAATGCAGACCCGACGAGTGTTAcagcag  <  1:1351298/38‑1 (MQ=255)
                                        |            
AGGCGGTGAGGCGTTGGCGGCGGCAAATGCAGACCCGACGCGTGTTACAGCAG  >  W3110S.gb/4576491‑4576543

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑