Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,629,214 A→G R86R (CGT→CGC)  ytjB ← conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,629,2140AG100.0% 396.9 / NA 138R86R (CGT→CGC) ytjBconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/138);  total (0/138)

Only 100 of 138 total aligned reads displayed.

CCTTGTTCGTCATACACACCCGCGTCGAGGATACGG  >  W3110S.gb/4629182‑4629217
                                |   
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ccTTGTTCGTCATACACACCCGCGTCGAGGATGCgg  <  1:592333/36‑1 (MQ=255)
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                                |   
CCTTGTTCGTCATACACACCCGCGTCGAGGATACGG  >  W3110S.gb/4629182‑4629217

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑