Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 73,208 T→C L438L (TTA→TTG thiP ← fused subunits of thiamin transporter and membrane components of ABC superfamily

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb73,2080TC100.0% 345.4 / NA 120L438L (TTA→TTGthiPfused subunits of thiamin transporter and membrane components of ABC superfamily
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/120);  total (0/120)

Only 100 of 120 total aligned reads displayed.

CCTTCAATCCCCAGCGACTGACATAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGTT  >  W3110S.gb/73185‑73246
                       |                                      
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ccTTCAATGCCCAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:545138/62‑1 (MQ=255)
ccTTCAATGCCCAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:529558/62‑1 (MQ=255)
ccTTCAATGCCCAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:500971/62‑1 (MQ=255)
ccTTCAATGCCCAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:487704/62‑1 (MQ=255)
ccTTCAATGCCCAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:478472/62‑1 (MQ=255)
ccTTCAATGCCCAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:442412/62‑1 (MQ=255)
ccTTCAATGCCCAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:433727/62‑1 (MQ=255)
ccTTCAATGCCCAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:431829/62‑1 (MQ=255)
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ccTTCAATGCCCAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:406066/62‑1 (MQ=255)
ccTTCAATGCCCAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:573231/62‑1 (MQ=255)
ccTTCAATGCCCAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:360029/62‑1 (MQ=255)
ccTTCAATGCCCAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:359919/62‑1 (MQ=255)
ccTTCAATGCCCAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:352851/62‑1 (MQ=255)
ccTTCAATGCCCAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:320341/62‑1 (MQ=255)
ccTTCAATGCCCAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:319878/62‑1 (MQ=255)
ccTTCAATGCCCAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:262664/62‑1 (MQ=255)
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ccTTCAATGCCCAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:890716/62‑1 (MQ=255)
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ccTTCAATGCCCAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:8675/62‑1 (MQ=255)
ccTTCAATGCCCAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:858164/62‑1 (MQ=255)
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ccTTCAATGCCCAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:1101360/62‑1 (MQ=255)
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ccTTCAATGCACAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:1269156/62‑1 (MQ=255)
    cAATGCCCAGCGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:181012/58‑1 (MQ=255)
              cGACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:811785/48‑1 (MQ=255)
               gACTGACACAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGtt  <  1:530500/47‑1 (MQ=255)
                       |                                      
CCTTCAATCCCCAGCGACTGACATAACATGCTGTAGCGGGCGGTGATATCGCGCATCGGGTT  >  W3110S.gb/73185‑73246

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: